Reis einweichen: Rundkornreis über Nacht (ca. 8–12 Stunden) in reichlich Wasser einweichen.
Reis kochen oder dämpfen: Den eingeweichten Reis in einem Topf oder Reisdämpfer garen, bis er weich und klebrig ist. Die Kochzeit beträgt etwa 20–30 Minuten.
Abtropfen und abkühlen lassen: Den Reis durch ein Sieb abgießen und in einer Auflaufform oder flachen Schale verteilen. Er sollte nicht zu feucht sein und auf Zimmertemperatur abkühlen.
Koji-Sporen vorbereiten: Die Koji-Sporen in einer kleinen Schale mit Mehl oder Speisestärke vermischen, um die Verteilung auf dem Reis zu erleichtern.
Reis impfen: Die Sporen-Mischung gleichmäßig über den abgekühlten Reis streuen und vorsichtig, aber gründlich unterheben, bis alle Körner bedeckt sind.
Fermentationsphase: Den Reis glattstreichen und mit einem feuchten Tuch abdecken. An einen warmen Ort stellen (ideale Temperatur 28–30 °C, möglich sind auch 24–26 °C; bei niedrigeren Temperaturen dauert die Fermentation länger). Inkubator, Plattenbox oder ein zugedeckter, warmer Raum sind geeignet.
Überwachung: Nach ca. 2 Tagen sollte der Reis leicht süßlich riechen. Nach 3–4 Tagen (bei kühleren Temperaturen bis zu 5 Tagen) ist der Reis vollständig mit Koji überzogen, riecht blumig-süß und lässt sich zerbröseln.
Verwendung: Der fertige Koji-Reis kann direkt weiterverwendet werden, z. B. für Sojasauce, Miso, Marinaden oder andere fermentierte Gerichte.